如果由第三方保管或控制的存货，注册会计师应实施的审计程序包括：1.向持有被审计单位存货的第三方函证存货的数量和状况；2.实施检查或其他适合具体情况的审计程序；3.实施或安排其他注册会计师实施对第三方的存货监盘（如可行）；4.获取其他注册会计师或服务机构注册会计师针对用以保证存货得到恰当盘点和保管的内部控制的适当性而出具的报告；5.检查与第三方持有的存货相关的文件记录；6.当存货被作为抵押品时，要求其他机构或人员进行确认。